Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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