Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PDCD1Q15116 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDCD1Q15116 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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