Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms