Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FHL3Q13643 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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