Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD10P28358 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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