Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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