Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

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Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ITGA4P13612 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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