Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms