Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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