Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRRIQ1Q96JM4 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms