Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms