Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RTL8BQ17RB0 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RTL8BQ17RB0 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RTL8BQ17RB0 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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RTL8BQ17RB0 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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