Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
R3HDM1Q15032 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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