Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 CDK2AP2P1-201ENST00000617479 328 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC084876.2-201ENST00000624844 1709 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC010320.4-201ENST00000594379 1905 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC116456.2-201ENST00000623018 2209 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 UNC5D-205ENST00000449677 2448 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 TRIM55-201ENST00000276573 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 LINC01139-201ENST00000400946 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 FSD1L-203ENST00000394926 1947 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC244034.1-201ENST00000428027 792 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RPL10AP1-201ENST00000490023 643 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC091805.1-201ENST00000498395 342 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 OR7E28P-201ENST00000505191 975 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ZNF610-203ENST00000403906 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 USP17L8-201ENST00000527080 1593 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 NLRC4-201ENST00000342905 1362 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 AL354984.1-201ENST00000371169 1854 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CAMK2BQ13554 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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