Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL162632.3-201ENST00000566976 1625 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms