Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXD4Q12950 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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