Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms