Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OTUD4Q01804 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms