Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TMPOP42166 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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