Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC009502.1-204ENST00000442416 361 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC096536.2-201ENST00000450503 343 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC069287.2-201ENST00000526963 574 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ALG1L9P-205ENST00000532875 549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL627309.1-201ENST00000466430 2748 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC139493.2-201ENST00000508056 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RCAN1-205ENST00000443408 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 AC108062.1-203ENST00000511497 2012 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SLC30A8-202ENST00000456015 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 C1orf116-202ENST00000461135 3142 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 CRISPLD2-201ENST00000262424 4586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HBS1L-203ENST00000367822 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 MIR4517-201ENST00000578855 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LINC01444-202ENST00000581211 654 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF561-AS1-206ENST00000591056 551 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 FAM166B-206ENST00000619051 1026 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL359741.1-201ENST00000621262 225 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SPECC1-205ENST00000395529 4971 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HSPA2-202ENST00000394709 5400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ARHGAP21-203ENST00000396432 7167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PCSK2-201ENST00000262545 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 NXPE3-207ENST00000616286 1832 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 UTP14A-202ENST00000425117 2403 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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