Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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