Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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