Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SAMD8Q96LT4 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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SAMD8Q96LT4 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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SAMD8Q96LT4 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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SAMD8Q96LT4 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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SAMD8Q96LT4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SAMD8Q96LT4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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