Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms