Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms