Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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