Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC135068.9-201ENST00000628927 355 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR941-3-201ENST00000637366 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 VNN3-204ENST00000414302 1312 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FPGT-201ENST00000370894 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADAM20P3-201ENST00000508710 2106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR11M1P-201ENST00000415975 895 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL359738.1-201ENST00000419667 430 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 TMEM256P2-201ENST00000440241 341 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL389889.1-201ENST00000443747 566 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MT1G-202ENST00000444837 406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL008718.1-201ENST00000445867 487 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 LY86-AS1-203ENST00000447858 938 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC139887.1-201ENST00000454037 286 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 YAP1P2-201ENST00000455104 610 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 VAMP7-203ENST00000460621 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 LINC00900-202ENST00000501294 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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ANKRD39Q53RE8 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP35-201ENST00000513369 976 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00681-201ENST00000530150 504 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01588-211ENST00000556434 892 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SHBG-209ENST00000572182 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SHBG-218ENST00000576728 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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