Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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