Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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