Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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