Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms