Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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