Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CACNA1SQ13698 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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