Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms