Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms