Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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