Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CENPFP49454 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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CENPFP49454 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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