Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TMPOP42166 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TMPOP42166 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms