Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms