Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TDRD12Q587J7 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms