Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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