Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BPTFQ12830 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BPTFQ12830 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BPTFQ12830 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BPTFQ12830 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BPTFQ12830 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BPTFQ12830 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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