Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ACTBP60709 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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ACTBP60709 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ACTBP60709 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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ACTBP60709 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ACTBP60709 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ACTBP60709 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ACTBP60709 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACTBP60709 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ACTBP60709 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ACTBP60709 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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