Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ZBED1O96006 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ZBED1O96006 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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