Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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SH3BP1Q9Y3L3 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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SH3BP1Q9Y3L3 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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SH3BP1Q9Y3L3 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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