Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1P10-201ENST00000508631 558 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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