Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C3orf67-206ENST00000472469 4108 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD20A3-201ENST00000611388 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ME1-201ENST00000369705 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RPH3A-219ENST00000551052 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02181-201ENST00000430050 4083 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms