Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTBP4Q8N2S1 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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