Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AP000350.7-201ENST00000624923 8030 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms