Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms